No hubo sorpresas en la clasificación de Malasia y los dos Mercedes ocuparán la primera fila de la grilla del domingo. Lewis Hamilton se quedó con la pole sobre Nico Rosberg.
Los Red Bull fueron superiores a los Ferrari, situando a Max Verstappen y Daniel Ricciardo por delante de Sebastian Vettel y Kimi Raikkonen. De gran labor Jenson Button consiguiendo el 9° lugar en Q3.
Rosberg cometió un error al final de su vuelta de Q3 y finalmente se tendrá que conformar con la segunda posición detrás de Hamilton.
Clasificación – Malasia.
| POS | N° | piloto | Q1 | Q2 | Q3 |
| 1 | 44 | Lewis Hamilton | 1:34.444 | 1:33.046 | 1:32.850 |
| 2 | 6 | Nico Rosberg | 1:34.460 | 1:33.609 | 1:33.264 |
| 3 | 33 | Max Verstappen | 1:35.443 | 1:33.775 | 1:33.420 |
| 4 | 3 | Daniel Ricciardo | 1:35.079 | 1:33.888 | 1:33.467 |
| 5 | 5 | Sebastian Vettel | 1:34.557 | 1:33.972 | 1:33.584 |
| 6 | 7 | Kimi Räikkönen | 1:34.556 | 1:33.903 | 1:33.632 |
| 7 | 11 | Sergio Perez | 1:35.068 | 1:34.538 | 1:34.319 |
| 8 | 27 | Nico Hulkenberg | 1:34.827 | 1:34.441 | 1:34.489 |
| 9 | 22 | Jenson Button | 1:35.267 | 1:34.431 | 1:34.518 |
| 10 | 19 | Felipe Massa | 1:35.267 | 1:34.422 | 1:34.671 |
| 11 | 77 | Valtteri Bottas | 1:35.166 | 1:34.577 | |
| 12 | 8 | Romain Grosjean | 1:35.400 | 1:35.001 | |
| 13 | 21 | Esteban Gutierrez | 1:35.658 | 1:35.097 | |
| 14 | 20 | Kevin Magnussen | 1:35.593 | 1:35.277 | |
| 15 | 26 | Daniil Kvyat | 1:35.695 | 1:35.369 | |
| 16 | 55 | Carlos Sainz | 1:35.605 | 1:35.374 | |
| 17 | 9 | Marcus Ericsson | 1:35.816 | ||
| 18 | 12 | Felipe Nasr | 1:35.949 | ||
| 19 | 30 | Jolyon Palmer | 1:35.999 | ||
| 20 | 31 | Esteban Ocon | 1:36.451 | ||
| 21 | 94 | Pascal Wehrlein | 1:36.587 | ||
| 22 | 14 | Fernando Alonso | 1:37.155 |